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SATO Tadashi

    Graduate School of Pharmaceutical Sciences Department of Structural Biology and Biomolecular Engineering　Associate Professor
Last Updated :2025/04/29

Researcher Information

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Research Interests

  • 創薬化学   農芸化学   農薬   小胞体   レクチン   立体構造解析   酵素   生物物理   糖鎖   蛋白質   糖タンパク質   生化学   糖鎖生物学   蛋白質工学   構造生物学   Ｘ線結晶構造解析   蛋白質科学   

Research Areas

  • Life sciences / Biophysics
  • Life sciences / Pharmaceuticals - analytical and physicochemistry
  • Life sciences / Structural biochemistry

Academic & Professional Experience

  • 2021/10 - Today  株式会社アグロデザインスタジオシニアサイエンティスト
  • 2011/04 - 2021/09  Nagoya City UniversityGraduate School of Pharmaceutical Sciences
  • 2013/10 - 2017/03  科学技術振興機構さきがけ研究者（兼任）
  • 2008/09 - 2011/03  理化学研究所 基幹研究所 研究員
  • 2007/09 - 2008/08  National Cancer Institute, NIH, Postdoctoral Fellow
  • 2003/04 - 2007/08  High Energy Accelerator Research Organization

Education

  • 2000/04 - 2003/03  日本大学大学院  生物資源科学研究科  生物資源利用科学専攻 博士後期課程
  •        - 2003  Nihon University
  • 1998/04 - 2000/03  日本大学大学院  農学研究科  農芸化学専攻 博士前期課程
  • 1994/04 - 1998/03  Nihon University  農獣医学部  農芸化学科
  •        - 1998  Nihon University  Faculty of Agriculture and Veterinary Medicine

Association Memberships

  • PROTEIN SCIENCE SOCIETY OF JAPAN   THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN   THE JAPANESE BIOCHEMICAL SOCIETY   THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   日本結晶学会   日本糖質学会   

Published Papers

Books etc

  • Glycobiophysics
    Satoh, T; Kato, K (ContributorStructural aspects of ER glycoprotein quality-control system mediated by glucose tagging)Springer 2018
  • Biochemical Roles of Eukaryotic Cell Surface Macromolecules
    Zhang, Y; Yamaguchi, T; Satoh, T; Yagi-Utsumi, M; Kamiya, Y; Sakae, Y; Okamoto, Y; Kato K (ContributorConformational dynamics of oligosaccharides characterized by paramagnetism-assisted NMR spectroscopy in conjunction with molecular dynamics simulation)Springer 2015
  • 糖鎖の新機能開発・応用ハンドブック 創薬・医療から食品開発まで
    佐藤匡史; 加藤晃一 (Contributor糖タンパク質の細胞内運命（第2章・第9節）)NTS 2015

Conference Activities & Talks

  • Structural mechanisms underlying the ER quality control associated with glucose tagging  [Invited]
    Satoh T; Kato K
    Society for Glycobiology (SFG) Annual Meeting 2018  2018/11
  • グルコース残基を目印とした糖タンパク質品質管理メカニズムの構造基盤  [Invited]
    佐藤匡史; 加藤晃一
    理研シンポジウム「細胞内糖修飾の統合的ケミカルバイオロジー」  2018/01
  • 糖タンパク質品質管理メカニズムの構造基盤解明  [Invited]
    佐藤匡史; 加藤晃一
    第46回結晶成長国内会議  2017/11
  • レクチンによる動的な糖鎖の認識機構  [Invited]
    佐藤匡史; 鈴木達哉; Gengwei Yan; 谷中冴子; 矢木宏和; 山口拓実; 加藤晃一
    第4回レクチン研究会  2017/09
  • Structural insights into the ER quality control system mediated by glucose tagging  [Invited]
    Satoh T; Song C; Zhu T; Toshimori T; Murata K; Kamikubo H; Uchihashi T; Kato K
    RIKEN–Max Planck Joint Research Center for Systems Chemical Biology The 6th Symposium  2017/04
  • 糖鎖認識を介したタンパク質品質管理機構の構造基盤  [Invited]
    佐藤匡史; 加藤晃一
    平成28年度日本応用糖質科学会東日本シンポジウム  2016/07
  • 糖鎖を目印としたタンパク質品質管理機構の構造基盤  [Invited]
    佐藤匡史; Zhu T; 年森隆泰; 山口拓実; 加藤晃一
    第16回日本蛋白質科学会年会  2016/06
  • Structural insights into molecular assembly in the proteasomal systems  [Invited]
    Satoh T; Sikdar A; Murata K; Kozai T; Ishii K; Noda M; Kawamura H; Yagi H; Yagi-Utsumi M; Uchiyama S; Uchihashi T; Kato K
    The 7th Japan-Taiwan joint meeting on neutron and X-ray scattering  2016/03
  • Structural insights into glycoprotein processing mechanisms in ER quality control system  [Invited]
    Satoh T; Kato K
    第87回日本生化学会  2014/10
  • Structural basis for the glycan-processing mechanisms in glycoprotein quality control system  [Invited]
    Satoh T; Kato K
    The 52nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan  2014/09
  • 糖タンパク質の輸送と分解に関わる細胞内レクチンの構造生物学研究  [Invited]
    佐藤匡史
    第31回 日本糖質学会年会  2012/09
  • 細胞内レクチンによる糖タンパク質品質管理の構造基盤  [Invited]
    佐藤匡史
    東京糖鎖研究会（GlycoTokyo）2011シンポジウム  2011/12
  • 糖鎖認識を介した糖タンパク質の輸送と分解の構造基盤  [Invited]
    佐藤匡史
    平成23年度日本結晶学会年会  2011/11
  • Structural basis of sugar recognition by intracellular lectins involved in glycoprotein transport and degradation  [Invited]
    Satoh T
    Nagoya University Global COE Mini-Symposium:Toward Systems Glycobiology“Biosynthesis and catabolism of glycoproteins  2011/11
  • 小胞体品質管理機構に関わる細胞内レクチンOS-9の構造生物学研究  [Invited]
    佐藤匡史
    第8回JCGGシンポジウム  2010/11
  • Structural basis for carbohydrate recognition of misfolded glycoproteins by OS-9 MRH domain in ER-associated degradation  [Invited]
    Satoh T; Hu D; Chen Y; Hanashima S; Yamamoto K; Yamaguchi Y
    International Symposium on Organelle Network  2010/04

MISC

Awards & Honors

  • 2016/10 平成28年度名古屋市立大学学長表彰
     
    受賞者: 佐藤 匡史
  • 2013/11 名古屋市立大学大学院薬学研究科 教員個人評価優秀者
     
    受賞者: 佐藤 匡史
  • 2012/12 日本大学生物資源科学部学部 学部長賞
     
    受賞者: 佐藤 匡史
  • 2012/09 日本糖質学会奨励賞
     
    受賞者: 佐藤 匡史
  • 2011/12 東京糖鎖研究会奨励賞
     
    受賞者: 佐藤 匡史

Research Grants & Projects

  • Elucidation of the molecular mechanisms underlying protein-specific glycosylation and development of artificial glycoproteins
    文部科学省：科学研究費補助金 基盤研究(B)
    Date (from‐to) : 2019 -2022 
    Author : SATOH Tadashi
  • 多元的構造生物学アプローチによるプロテアソーム形成機構の解明と創薬への展開
    文部科学省：科学研究費補助金 基盤研究(A)
    Date (from‐to) : 2014 -2019 
    Author : 加藤晃一
  • Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2015/04 -2018/03 
    Author : Yagi Hirokazu; KATO Koichi; SUGIYAMA Masaaki; SATOH Tadashi; YAMAGUCHI Takumi
     
    LARGE (Like-acetylglucosaminyltransferase) is the causative gene product for congenital muscular dystrophy which possesses two catalytic domains with homology to members of glycosyltransferases to form a repeat sequence of xylose and glucuronic acid residues. In this study, we have performed a molecular dynamics study to characterize the mechanism that the enzymes composed of these two catalytic domains catalyze the elongation reactions of sugar chains. As a result, the enzymes exhibited dynamic motions involving domain-domain association and dissociation during the reaction, indicating that orientation between the two domains would contribute to the elongation efficiency to exchange the substrate sugar chain.
  • 生命分子の動的秩序形成におけるミクロ‐マクロ相関の探査と設計原理の探求
    文部科学省: 科学研究費補助金 新学術領域研究(研究領域提案型)
    Date (from‐to) : 2013 -2018 
    Author : 加藤晃一
  • 小胞体糖タンパク質フォールディング装置作動メカニズムの解明
    科学技術振興機構：戦略的創造研究推進事業 さきがけ
    Date (from‐to) : 2013 -2017 
    Author : 佐藤匡史
  • 糖タンパク質選別輸送装置の超分子形成および作動機構の解明
    文部科学省: 科学研究費補助金 新学術領域研究(研究領域提案型)
    Date (from‐to) : 2013 -2015 
    Author : 佐藤匡史
  • 糖鎖認識系を標的とする創薬を目指した複合糖質機能の構造基盤の解明と分子設計
    文部科学省: 科学研究費補助金 基盤研究(A)
    Date (from‐to) : 2012 -2015 
    Author : 加藤晃一
  • Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2012/04 -2014/03 
    Author : KATO Koichi; YAMAGUCHI Takumi; YAGI Maho; SATOH Tadashi
     
    Assembly of the eukaryotic 20S proteasome is not spontaneous self-organization but an ordered process involving several assembly chaperones, whereas that of the archaeal 20S proteasome involves spontaneous self-assembly. Recent genomic analysis identified archaeal homologs of the assembly chaperones, PbaA and PbaB. However, it remains unclear how such assembly chaperone-like proteins play an indispensable role in assembly of the proteasome subunit in archaea. This study revealed that PbaB actually functions as a proteasome activator. Furthermore, our integrative biochemical and biophysical approach including X-ray crystallography, electron microscopy, NMR spectroscopy, and small-angle neutron scattering provided mechanistic clues to the molecular action of the active complex formed between the PbaB homotetramer and 20S proteasome.
  • 好熱性真核生物のゲノム情報を基盤とした小胞体関連分解装置の構造生物学研究
    文部科学省: 科学研究費補助金 若手研究(B)
    Date (from‐to) : 2012 -2014 
    Author : 佐藤匡史
  • GPIアンカー型タンパク質の輸送シグナルの提示と検知の構造生物学
    文部科学省: 科学研究費補助金 新学術領域研究(研究領域提案型)
    Date (from‐to) : 2011 -2013 
    Author : 佐藤匡史
  • 糖鎖が関わる小胞体品質管理機構の構造生物学研究
    文部科学省: 科学研究費補助金 特定領域研究
    Date (from‐to) : 2010 -2012 
    Author : 佐藤匡史
  • 日本学術振興会：科学研究費助成事業
    Date (from‐to) : 2010 -2011 
    Author : 佐藤 匡史; 山口 芳樹
     
    本研究では、糖鎖が関わる小胞体関連分解の中心的な役割を担っている小胞体レクチン(OS-9)、マンノシダーゼ様タンパク質(EDEM)に着目し、ミスフォールド糖タンパク質認識機構の構造基盤を解明することを目的とした。また、その分解経路において最終的なタンパク質分解を担うプロテアソームの制御機構にも着目した。 (1)マンノシダーゼ様タンパク質EDEMの大量発現系の構築 これまで構造生物学研究の遂行に十分量のEDEMを大量発現させた報告例は無い。そこで、哺乳動物細胞に加えて、大腸菌発現系の検討を行った。大腸菌での可溶性大量発現のネックになるジスルフィド結合に着目し、プロテインジスルフィドイソメラーゼ(PDI)を融合タンパク質として発現させるベクター(pCold-PDI)を創成した。現在、本研究基盤を用いて、EDEMについて検討を進めている。 (2)新規プロテアソーム活性化因子PbaBの同定および立体構造解析 プロテアソームは分解活性中心をもつ20Sプロテアソームと、その両端に結合することにより分解を促進するプロテアソーム活性化因子から構成される。真核生物では、20Sプロテアソームは一連の集合因子の介助を受けて複雑な四次構造が形成される。一方、古細菌の20Sプロテアソームはそれぞれのサブユニットが自発的に集合する。最近興味深いことに、古細菌においても集合因子様タンパク質PbaBが見出された。本研究ではプロテアソーム系におけるPbaBの機能を明らかにするために、多角的な構造機能解析を行った。 集合因子様タンパク質として見出されたPbaBは、シャペロン活性を示し、ATP非依存的に20Sプロテアソームによる変性タンパク質の分解を促進した。きらに、X縁結晶構造および電子顕微鏡解析により、PbaBが従来とは異なる機構で20Sプロテアソームによる基質タンパク質分解を促進することを明らかにした。
  • Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2009 -2011 
    Author : KATO Koichi; YAMAGUCHI Takumi; KAMIYA Yukiko; MIZUSHIMA Tsunehiro; SATO Tadashi
     
    In cells, the carbohydrate moieties serve as tags for the quality control of glycoproteins through interactions with a variety of lectins. To elucidate the mechanisms underlying the glycoprotein quality control by the lectins that cycle between the endoplasmic reticulum and the Golgi, we provided the structural basis for their molecular recognition and complex formation by structural biological approaches such as X-ray crystallography. Furthermore, we successfully developed novel NMR methods for detailed analyses of conformational dynamics of the carbohydrate chains involved in this system.

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