Researchers Database

OKUNO Yusuke

    Graduate School of Medical Sciences Department of Virology Professor
Last Updated :2024/04/27

Researcher Information

URL

Research funding number

  • 00725533

J-Global ID

Research Interests

  • Epstein-Barrウイルス   慢性活動性Epstein-Barrウイルス感染症   感染がん   小児がん   稀少がん   CRISPRスクリーニング   シングルセル解析   Epstein-Barrウイルス関連胃癌   先天性骨髄不全症候群   若年性骨髄単球性白血病   網羅的遺伝子解析   急性リンパ性白血病   MEF2D融合遺伝子   

Research Areas

  • Life sciences / Virology
  • Life sciences / Tumor biology
  • Life sciences / Hematology and oncology

Academic & Professional Experience

  • 2021/06 - Today  Nagoya City UniversityGraduate School of Medical Sciences Department of VirologyProfessor
  • 2019/04 - 2021/05  Nagoya UniversityNagoya University HospitalLecturer of hospital
  • 2015/01 - 2019/03  Nagoya UniversityNagoya University Hospital Center for Advanced Medicine and Clinical ResearchDesignated lecturer
  • 2013/10 - 2014/12  Nagoya UniversityHospital Pediatric Cancer Treatment CenterAssistant professor of hospital

Education

  • 2008/04 - 2012/03  Nagoya University  Graduate School of Medicine  Pediatrics
  • 2000/04 - 2006/03  Nagoya University  Faculty of Medicine

Association Memberships

  • 日本ウイルス学会   American Society of Hematology   日本造血細胞移植学会   日本癌学会   日本血液学会   

Published Papers

Conference Activities & Talks

  • Epstein-Barrウイルスが難治性感染症やがんを引き起こす遺伝学的機構  [Invited]
    奥野友介
    第25回東海小児感染症研究会  2022/11
  • 慢性活動性Epstein-Barrウイルス(EBV)感染症とEBV感染がんにおける欠損ウイルスとその役割  [Invited]
    奥野友介
    第63回日本臨床ウイルス学会  2022/06
  • Structural variations of the Epstein-Barr virus genome in hematological and epithelial cell malignancies
    奥野友介; 村田貴之; 佐藤好隆; 伊藤嘉規; 澤田明久; 大島孝一; 加藤省一; 中黒匡人; 佐藤啓; 木村宏
    第68回日本ウイルス学会学術集会  2021/11
  • Epstein-Barrウイルスによる発がん機構の理解と制圧  [Invited]
    奥野友介
    令和3年度順清会総会  2021/10
  • Prevalence of defective Epstein-Barr virus in hematological and epithelial cell malignancies  [Not invited]
    Yusuke Okuno; Takayuki Murata; Yoshitaka Sato; Yoshinori Ito; Akihisa Sawada; Koichi Oshima; Seiichi Kato; Masato Nakaguro; Akira Satou; Hiroshi Kimura
    第83回日本血液学会学術集会  2021/09
  • Epstein–Barr virus carrying structural variations in hematological and epithelial cell malignancies  [Not invited]
    Yusuke Okuno; Takayuki Murata; Yoshitaka Sato; Yoshinori Ito; Akihisa Sawada; Koichi Oshima; Seiichi Kato; Masato Nakaguro; Akira Satou; Hiroshi Kimura
    19th International Symposium on Epstein-Barr Virus and associated diseases  2021/07
  • Genetics of chronic active EBV infection (CAEBV) and defective EBV in hematological malignancy  [Invited]
    Yusuke Okuno
    U.S.-Japan Cooperative Medical Sciences Program (USJCMSP) 22nd International Conference on Emerging Infectious Diseases in the Pacific Rim  2020/02  Bangkok, Thailand  U.S.-Japan Cooperative Medical Sciences Program (USJCMSP)
  • Comprehensive Mutational Analysis of Juvenile Myelomonocytic Leukemia using Whole-genome Sequencing  [Not invited]
    Yusuke Okuno; Hideki Muramatsu; Norihiro Murakami; Nozomu Kawashima; Manabu Wakamatsu; Hironobu Kitazawa; Tomoo Ogi; Yoshiyuki Takahashi
    61st American Society of Hematology Annual Meeting and Exposition  2019/12
  • Whole-genome mutational landscape of juvenile myelomonocytic leukemia  [Not invited]
    Yusuke Okuno; Hideki Muramatsu; Norihiro Murakami; Manabu Wakamatsu; Hironobu Kitazawa; Tomoo Ogi; Yoshiyuki Takahashi
    第81回日本血液学会学術集会  2019/10
  • Whole-genome mutational analysis of juvenile myelomonocytic leukemia  [Invited]
    Yusuke Okuno; Hideki Muramatsu; Norihiro Murakami; Manabu Wakamatsu; Hironobu Kitazawa; Tomoo Ogi; Yoshiyuki Takahashi
    第78回日本癌学会学術総会  2019/09
  • The presence of defective Epstein-Barr virus (EBV) in chronic active EBV infection and hematological malignancy  [Invited]
    Yusuke Okuno
    第78回日本癌学会学術総会  2019/09
  • The Presence of Defective Epstein-Barr virus (EBV) Infection in Patients with EBV-associated Hematological Malignancy  [Not invited]
    Yusuke Okuno; Takayuki Murata; Yoshitaka Sato; Hideki Muramatsu; Yoshinori Ito; Takahiro Watanabe; Tatsuya Okuno; Norihiro Murakami; Kenichi Yoshida; Akihisa Sawada; Masami Inoue; Keisei Kawa; Masao Seto; Koichi Ohshima; Yuichi Shiraishi; Kenichi Chiba; Hiroko Tanaka; Satoru Miyano; Yohei Narita; Masahiro Yoshida; Fumi Goshima; Jun-ichi Kawada; Tetsuya Nishida; Hitoshi Kiyoi; Seiichi Kato; Shigeo Nakamura; Satoko Morishima; Shigeyoshi Fujiwara; Norio Shimizu; Yasushi Isobe; Masaaki Noguchi; Atsu
    60th American Society of Hematology Annual Meeting and Exposition  2018/12
  • 慢性活動性Epstein-Barrウイルス感染症における網羅的遺伝子解析  [Not invited]
    奥野友介; 村田貴之; 佐藤好隆; 村松秀城; 伊藤嘉規; 奥野達矢; 村上典寛; 吉田健一; 澤田明久; 井上雅美; 河敬世; 瀬戸加大; 大島孝一; 白石友一; 千葉健一; 田中洋子; 宮野悟; 成田洋平; 吉田全宏; 渡辺崇広; 五島典; 川田潤一; 西田徹也; 清井仁; 加藤省一; 中村栄男; 森島聡子; 藤原成悦; 清水則夫; 磯部泰司; 野口雅章; 菊田敦; 岩月啓氏; 高橋義行; 小島勢二; 小川誠司; 木村宏
    第80回日本血液学会学術集会  2018/10
  • The presence of defective Epstein-Barr virus (EBV) infection in EBV-associated hematological malignancies  [Not invited]
    Yusuke Okuno; Takayuki Murata; Yoshitaka Sato; Yoshinori Ito; Kenichi Yoshida; Akihisa Sawada; Yuichi Shiraishi; Satoru Miyano; Yoshiyuki Takahashi; Seiji Kojima; Seishi Ogawa; Hiroshi Kimura
    第77回日本癌学会学術総会  2018/09
  • Comprehensive genetic analysis to identify causative mutations in hematological malignancies  [Invited]
    奥野友介
    名古屋大学大学院医学系研究科プレミアムレクチャー(第3回)  2018/01
  • Genetic background of chronic active Epstein-Barr virus disease  [Not invited]
    Yusuke Okuno; Takayuki Murata; Yoshitaka Sato; Hideki Muramatsu; Tatsuya Okuno; Kenichi Yoshida; Yoshinori Ito; Akihisa Sawada; Koichi Ohshima; Yuichi Shiraishi; Kenichi Chiba; Hiroko Tanaka; Satoru Miyano; Yoshiyuki Takahashi; Seiji Kojima; Seishi Ogawa; Hiroshi Kimura
    59th American Society of Hematology Annual Meeting and Exposition  2017/12
  • 遺伝性造血不全疾患群のクリニカルシーケンス  [Invited]
    奥野友介
    第79回日本血液学会学術集会  2017/10
  • Next-generation sequencing-based minimal residual disease detectoin in ALL  [Invited]
    Yusuke Okuno
    2017 The Korean Society of Pediatric Hematology-Oncology spring meeting  2017/04
  • Next-generation sequencing in Leukemia  [Invited]
    Yusuke Okuno
    Precision Oncology: Clinical and Genomics Data from Thai patients vs. Global Counterparts  2017/03
  • 若年性骨髄単球性白血病における急性転化の網羅的遺伝子解析  [Not invited]
    Okuno Y; Kawashima N; Muramatsu H; Sakaguchi H; Yoshida K; Shiraishi Y; Murakami N; Chiba K; Tanaka H; Narita A; Nishio N; Hama A; Kojima S; Miyano S; Ogawa S; Takahashi Y
    第78回日本血液学会学術集会  2016/10
  • 家族性骨髄異形成症候群におけるGATA2遺伝子変異および二次性遺伝子変異の解析  [Not invited]
    Okuno Y; Wang X; Muramatsu H; Sakaguchi H; Yoshida K; Kawashima N; Shiraishi Y; Chiba K; Tanaka H; Saito S; Nakazawa Y; Xu Y; Masunari T; Hirose T; Narita A; Doisaki S; Hama A; Miyano S; Takahashi Y; Ogawa S; Kojima S
    第57回日本小児血液・がん学会学術集会  2015/11
  • 先天性骨髄不全症の遺伝子診断におけるターゲットシークエンスの臨床的有用性  [Not invited]
    Okuno Y; Muramatsu H; Yoshida K; Shiraishi Y; Doisaki S; Narita A; Kawashima N; Wang X; Xu Y; Sekiya Y; Chiba K; Tanaka H; Nishio N; Hama A; Takahashi Y; Ogawa S; Miyano S; Kojima S
    第77回日本血液学会学術集会  2015/10
  • 難治性小児急性リンパ性白血病に対する臨床応用を目的としたトランスポゾン法による抗CD19キメラ抗原受容体導入T細胞の培養法の確立  [Not invited]
    奥野友介; 西尾信博; 川島希; 鈴木哲; 関屋由子; 村松秀城; 濱麻人; 中沢洋三; 高橋義行; 小島勢二
    第37回日本造血細胞移植学会総会  2015/03
  • Whole-exome sequencing reveals a paucity of somatic gene mutations in aplastic anemia and refractory cytopenia of childhood.  [Not invited]
    Okuno Y; Narita A; Muramatsu H; Yoshida K; Hama A; Wang X; Xu Y; Kawashima N; Sakaguchi H; Doisaki S; Takahashi Y; Shiraishi Y; Chiba K; Tanaka H; Miyano S; Ogawa S; Kojima S
    56th ASH Annual Meeting & Exposition  2014/12
  • CRISPR/Casシステムを用いた若年性骨髄単球性白血病におけるRAS関連候補遺伝子スクリーニング  [Not invited]
    Okuno Y; Kawashima N; Muramatsu H; Hama A; Takahashi Y; Kojima S
    第56回日本小児血液・がん学会学術集会  2014/11
  • Diagnostic efficacy of whole-exome sequencing in 250 patients with congenital bone marrow failure (Scientific Exchange Training Program)  [Not invited]
    Okuno Y; Muramatsu H; Yoshida K; Doisaki S; Shiraishi Y; Hama A; Chiba K; Tanaka H; Sanada M; Takahashi Y; Miyano S; Ogawa S; Kojima S
    第76回日本血液学会学術集会 Scientific Exchange Training Program (SETP)  2014/11
  • 先天性骨髄不全症250例における全エクソーム解析の診断的価値  [Not invited]
    奥野友介; 村松秀城; 吉田健一; 土居崎小夜子; 白石友一; 濱麻人; 千葉健一; 田中洋子; 真田昌; 高橋義行; 宮野悟; 小川誠司; 小島勢二
    SETBP1 mutations in aplastic anemia evolving into myelodysplastic syndromes and acute myeloid leukemia with the acquisition of monosomy 7.  2014/11
  • SETBP1 mutations in aplastic anemia evolving into myelodysplastic syndromes and acute myeloid leukemia with the acquisition of monosomy 7.  [Not invited]
    Okuno Y; Xu Y; Muramatsu H; Wang X; Hama A; Yoshida K; Shiozawa Y; Shiraishi Y; Makishima H; Chiba K; Tanaka H; Yoshida N; Sanada M; Takahashi Y; Miyano S; Maciejewski JP; Ogawa S; Kojima S
    4th International Bone Marrow Failure Disease Scientific Symposium 2014  2014/03
  • De novo IL2RG遺伝子変異のmosaicismによる 遅発発症型重症複合型免疫不全症の一例  [Not invited]
    奥野友介; 村松秀城; 王希楠; 川島希; 岩田敦; 堀壽成; 鬼頭敏幸; 吉田健一; 宮野悟; 小川誠司; 小島勢二; 金兼弘和
    第7回日本免疫不全症研究会  2014/01
  • Clonal architecture and evolution of pediatric AML.  [Not invited]
    Okuno Y; Shiba N; Shiraishi Y; Yoshida K; Nagata Y; Sato Y; Ohki K; Kato M; Park MJ; Kanazawa T; Kudo K; Ito E; Takita J; Sanada M; Hayashi Y; Miyano S; Ogawa S
    第74回日本血液学会学術集会  2012/10
  • 腎淡明細胞癌の全ゲノム解析  [Not invited]
    Okuno Y; Sato Y; Maekawa S; Sato-Otsubo A; Suzuki H; Fujimoto A; Shiraishi Y; Chiba K; Tanaka H; Honma Y; Tsunoda T; Miyano S; Ogawa S
    第71回日本癌学会学術総会  2012/09

MISC

Industrial Property Rights

  • 特願2017-162389:若年性骨髄単球性白血病治療薬  2017年/08/25
    村松秀城, 奥野友介, 村上典寛  村松秀城、奥野友介、村上典寛
  • 特願2016-209066:チオプリン高感受性キメラ抗原受容体遺伝子改変リンパ球  2016年/11/14
    村松秀城, 奥野友介, 高橋義行, 中沢洋三, 松田和之  村松秀城、奥野友介、高橋義行、中沢洋三、松田和之
  • 特願2015-255179:急性リンパ性白血病関連の新規遺伝学的異常及びその利用  2015年/12/25
    奥野友介, 小島勢二, 鈴木喬悟, 川島希, 関屋由子  奥野友介、小島勢二、鈴木喬悟、川島希、関屋由子

Awards & Honors

  • 2019/09 日本癌学会 2019年度(第38回)日本癌学会奨励賞
     慢性活動性Epstein–Barrウイルス(EBV)感染症と血液悪性疾患における欠損EBVの発見 JPN international_society 
    受賞者: 奥野友介
  • 2016/10 日本血液学会 第77回日本血液学会奨励賞
     先天性骨髄不全症の遺伝子診断におけるターゲットシークエンスの臨床的有用性 JPN 
    受賞者: 奥野友介
  • 2015/11 日本小児血液・がん学会 第57回日本小児血液・がん学会プレナリー賞
     家族性骨髄異形成症候群におけるGATA2遺伝子変異および二次性遺伝子変異の解析 
    受賞者: 奥野友介
  • 2014/11 名古屋大学順清会 第39回名古屋大学順清会研究奨励賞
     ダウン症候群に合併する一過性異常骨髄増殖症および 急性巨核芽球性白血病の網羅的遺伝子解析 
    受賞者: 奥野友介
  • 2014/11 公益信託日本白血病基金 公益信託日本白血病基金一般研究賞
     CRISPR/Casシステムを用いた若年性骨髄単球性白血病における新規原因遺伝子の解析 
    受賞者: 奥野友介
  • 2014/02 名古屋癌治療国際シンポジウム 第29回名古屋癌治療国際シンポジウム BMS Award
     Exome sequencing identifies secondary mutations of SETBP1 and JAK3 in juvenile myelomonocytic leukemia JPN international_academic_award 
    受賞者: 坂口大俊;奥野友介;吉田健一;村松秀城
  • 2014/02 名古屋大学医学部大学院医学系研究科 第1回名古屋大学医学部大学院医学系研究科研究奨励賞
     全エクソーム解析により明らかとなった 若年性骨髄単球性白血病の遺伝学的機構 JPN international_society 
    受賞者: 奥野友介

Research Grants & Projects

  • 日本学術振興会:科学研究費助成事業
    Date (from‐to) : 2022/04 -2026/03 
    Author : 杉浦 真弓; 奥野 友介; 松浦 栄次; 大石 久史
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2022/04 -2025/03 
    Author : 成田 敦; 村松 秀城; 奥野 友介; 高橋 義行
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2022/04 -2025/03 
    Author : 奥野 友介
  • Epstein-Barrウイルス関連疾患を理解し制圧するための情報基盤の構築
    大幸財団:
    Date (from‐to) : 2023/10 -2025/03
  • 日本学術振興会:科学研究費助成事業 基盤研究(C)
    Date (from‐to) : 2021/04 -2024/03 
    Author : 加藤 省一; 奥野 友介
     
    リンパ節に病変の主座があり細胞傷害性分子が陽性となる末梢性T細胞リンパ腫-非特定型(PTCL-NOS)すなわち,節性細胞傷害性T細胞リンパ腫(nodal cytotoxic T-cell lymphoma [nCTL])は細胞傷害性分子陰性のPTCL-NOSより予後不良である.nCTLにはEBV陽性例と陰性例がある.また細胞傷害性分子が陽性となる成熟T/NK細胞リンパ腫の中で,EBVも陽性となる疾患としては,上気道を中心に侵す,節外性NK/T細胞リンパ腫,鼻型(NKTL)が広く知られている.上気道浸潤がなくリンパ節に病変の主座があり,EBVが陽性となる成熟T/NK細胞リンパ腫,すなわちEBV陽性nCTL(EBV-positive nCTL) は本研究の対象であるり,約20症例について,症例を集積し,全エクソームシークエンス,EBVゲノムのシークエンスを施行できた.また正常対応検体についても約半数の症例で全エクソームシークエンス等のデータの取得ができた.全ゲノムシークエンスも一部の症例で施行できた.現在得られたデータの解析及び,追加免疫染色等の病理学的検索が必要な症例について追加で検討を行っているところである. 現時点で解析できた範囲では,NKTLとEBV-positive nCTLはいずれもEBV陽性,細胞傷害性分子陽性の成熟T/NK細胞リンパ腫であるものの,既報のNKTLの変異プロファイルと比べ今回得られたEBV-positive nCTLの変異プロファイルは異なる可能性が示唆された.さらに解析を進め両者の違い,EBV-positive nCTLの生物学的特徴を明らかにしていく.
  • 日本学術振興会:科学研究費助成事業 基盤研究(C)
    Date (from‐to) : 2021/04 -2024/03 
    Author : 村松 秀城; 奥野 友介
     
    若年性骨髄単球性白血病(juvenile myelomonocytic leukemia; JMML)は、主に5歳未満の小児に発症する予後不良な造血器腫瘍である。唯一の根治療法は同種造血細胞移植であるが、一部の症例は無治療で長期生存することも知られており、予後を正確に予測するバイオマーカーに基づく最適医療(Precision Medicine)の実現が求められている。我々は、これまでの研究で網羅的遺伝子解析の技術を用いて遺伝子変異/遺伝子発現/遺伝子メチル化の各プロファイリングを行い、多くのJMMLの予後予測因子を明らかにした。 本研究では、クロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)を用いてヒストン修飾の網羅的プロファイリングを行い、JMMLの疾患特異的なエンハンサー領域の同定およびこれまでに得られている網羅的ゲノム情報との統合解析を通じて、分子学的発症メカニズムの全体像を明らかにすることを目標としている。これまでに、24例のJMML臨床検体を用いてChIP-Seq解析を完了し、JMML特異的にH3K27acのヒストンマークが濃縮しているエンハンサー領域の候補を抽出した。さらに、2021年度内にSingle-cell RNA-seqの解析手法を確立し、少数例ではあるがJMML臨床検体での解析を実施した。現在、すでに完了している他のゲノム解析結果(DNAシーケンス、RNAシーケンス、遺伝子メチル化解析)との統合解析を遂行中である。
  • 慢性活動性Epstein-Barrウイルス感染症の起因となるウイルス感染細胞の特定
    国立研究開発法人日本医療研究開発機構:難治性疾患実用化研究事業
    Date (from‐to) : 2021/04 -2024/03 
    Author : 奥野友介; 渡辺崇広; 村松秀城
  • 診断困難・治療抵抗性小児がんの全ゲノム解析による治療成績の改善
    名古屋小児がん基金:
    Date (from‐to) : 2023/10
  • 日本学術振興会:科学研究費助成事業 基盤研究(B)
    Date (from‐to) : 2020/04 -2023/03 
    Author : 木村 宏; 奥野 友介; 渡辺 崇広; 伊藤 嘉規
     
    Epstein-Barr virus (EBV) は、ほとんどの成人に感染している普遍的なウイルスである一方、様々なリンパ腫/上皮系腫瘍の原因ともなる。我々は最近、慢性活動性EBウイルス感染症に対して、次世代シーケンサーを用いた網羅的遺伝子解析を行い、高率にEBV遺伝子の一部が欠失していることを発見した。これまでの予備実験により、共通する複数の欠失遺伝子が、ある種のEBV関連リンパ腫に高頻度に認められることを見出している。本研究では、疾患に特有の欠失遺伝子をノックアウトした変異ウイルスを作成し、培養細胞を用いたin vitroおよびヒト化マウスを用いたin vivoモデルにより、ゲノム欠失の役割を解明することを目指している。 初年度は、先行研究にて欠損頻度の高かったC promoter (Cp)の意義を明らかにするために、Cp欠損株を作成し、Cp欠損により効率的にB細胞の形質転換を引き起こすこと、免疫不全マウスを用いたin vivoリンパモデルでリンパ増殖性疾患の進行が早まることを明らかにした。 二年目にあたる本年度は、EBV陽性バーキットリンパ腫で時に見られるEBNA2欠損についての解析を試みた。EBNA2を欠損したEBVをB細胞に感染させたところ、RNAseqにより免疫チェックポイント分子である宿主PD-L1の発現が減弱することを見出した。さらに、PD-L1の発現はEBV溶解感染を誘導し、NFκB、MAPK, AKT経路を活性化させ、EBNA2の欠損はこれらの発現を減弱させることを確認した。以上より、EBVはEBNA2の発現を介してPD-L1を誘導し、免疫回避を行っていることが推測された。
  • 日本学術振興会:科学研究費助成事業 基盤研究(C)
    Date (from‐to) : 2020/04 -2023/03 
    Author : 新美 薫; 奥野 友介
     
    次世代シーケンサーを用いた絨毛癌組織の全ゲノム解析を症例を追加して施行した。この結果から、遺伝子変異の同定を試みた。妊娠性絨毛癌肺転移検体を用いて抗腫瘍免疫応答の解析を行った。また、患者から樹立したxenograftモデルから、細胞株の樹立を試みた。 ①本人、パートナー、腫瘍の3検体を得ることができた絨毛癌3例と、絨毛癌細胞株6種類(JAR, BeWo, JEG3, CC1, CC3, CC4, CC6)に対して、DNAを抽出した。腫瘍検体は、パラフィン包埋ブロックからレーザーマイクロダイセクションを用いてDNAを抽出し、本人とパートナーからは頬粘膜からDNAを抽出した。それらを次世代シーケンサー(イルミナ社のHiSeq 2500)を用いて、全ゲノム解析を行い、遺伝子変異の同定を試みた。同様の症例と細胞株を用いて、コピー数の解析も行っている。 ②妊娠性絨毛癌の肺切除1例の組織から、抗腫瘍免疫応答の解析を行った。腫瘍先進部/傍腫瘍領域の各部位の組織から組織破砕法により組織浸潤免疫細胞を回収し、フローサイトメトリを使用して浸潤免疫細胞のサブセット解析を行った。妊娠性絨毛癌でも、非妊娠性絨毛癌と同様に通常のがん組織よりもNK細胞が多いことが示唆された。 ③非妊娠性絨毛癌患者の手術検体からPatient-derived xenograft(PDXモデル)を作成した。その腫瘍組織をヌードマウスに移植し、生着後、シスプラチンにて治療を行い、感受性を確認した。さらに、不死化細胞株の樹立を行い、hCG分泌を確認した。
  • 診断困難・治療抵抗性小児がんの全ゲノム解析による治療成績の改善
    名古屋小児がん基金:
    Date (from‐to) : 2022/10
  • 網羅的遺伝子解析とウイルス解析による慢性活動性EBウイルス感染症の病態解明
    武田科学振興財団:武田科学振興財団 生命科学研究助成
    Date (from‐to) : 2019/10 -2022/09 
    Author : 奥野友介
  • 診断困難・治療抵抗性小児がんの全ゲノム解析による治療成績の改善
    NPO法人deleteC:
    Date (from‐to) : 2022/09
  • The Interstellar Initiative (FY21)
    国立研究開発法人日本医療研究開発機構:
    Date (from‐to) : 2021/10 -2022/03 
    Author : 奥野友介
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2019/04 -2022/03 
    Author : Atsushi Narita
     
    We recurrently identified novel gene X mutations using whole exome analysis in children with aplastic anemia. We hypothesized that mutations in gene X might confer an advantage in myeloproliferation or immune escape in aplastic anemia patients. Using a mutant mouse model of gene X, we examined the functional significance of the novel gene X mutant allele in aplastic anemia. Bone marrow specimens were collected from gene X mutant mice and subjected to colony assay, expression analysis by RNA sequencing, MHC deletion analysis, and bone marrow competitive transplantation experiments. In all results, however, mutations in gene X showed no advantage over controls in myeloproliferation or immune escape.
  • 多中心性細網組織球症の疫学および治療法に関する調査研究
    厚生労働省:厚生労働科学研究費補助金
    Date (from‐to) : 2019/04 -2022/03
  • 網羅的遺伝子解析を用いた診断・治療困難な小児がんの治療成績改善
    愛知健康増進財団:
    Date (from‐to) : 2022/01
  • Epstein-Barrウイルス感染がん治療薬の開発
    国立研究開発法人日本医療研究開発機構:革新的がん医療実用化研究事業
    Date (from‐to) : 2019/11 -2021/03 
    Author : 奥野友介; 佐藤好隆; 村松秀城
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2018/04 -2021/03 
    Author : Muramatsu Hideki
     
    Juvenile myelomonocytic leukemia (JMML) is a pediatric myeloproliferative disease with a poor prognosis. We have constructed an international methylation classification using Illumina's 450k methylation array, but development of a lower-cost, high-throughput test method is required for implementation in actual clinical practice. In this study, we performed methylation analysis using the digital restriction enzyme analysis of methylation (DREAM) method, which combines two restriction enzymes that distinguish the presence or absence of methylation with next-generation sequencing technology. The DREAM method reproduces the results of the 450k methylation array with high accuracy, and has been established as a clinical test method for JMML.
    Translated with www.DeepL.com/Translator (free version)
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2018/04 -2021/03 
    Author : Al-Kzayer Lika'a
     
    Diagnostic/remission (paired) samples from 66 Iraqi children with acute leukemia including, 55 acute lymphoblastic leukemia (ALL) cases, and 11 acute myeloid leukemia (AML) cases, were evaluated in Japan using next generation sequencing (NGS). Flinders Technology Associates (FTA) cards used to transfer samples from Iraq, were proved to be good enough to yield an adequate dried blood spot-derived DNA suitable for NGS analysis. Iraqi childhood ALL and AML samples were successfully analyzed. B-ALL represented 49 (89.1%) of ALL cases, and they were categorized into subsets according to the molecular driver, such as chromosomal aneuploidy, rearrangements, and point mutations. Several of these subsets were comparable to the results elsewhere in terms of frequency, except for the striking findings of a highly recurrent TCF3-PBX1 fusion gene of (22.4%) in B-ALL, also a highly frequent RAS signaling pathway mutations of about (45%) was disclosed in each of ALL and AML Iraqi childhood cohorts.
  • 網羅的遺伝子解析による小児がんの治療成績改善
    NPO法人deleteC:NPO法人deleteC 研究助成
    Date (from‐to) : 2019/12 -2020/11 
    Author : 奥野友介
  • ありふれたウイルスが「がん」をもたらす謎の解明
    公益財団法人堀科学芸術振興財団:公益財団法人堀科学芸術振興財団研究助成
    Date (from‐to) : 2018/06 -2020/05 
    Author : 木村
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    Date (from‐to) : 2018/04 -2020/03 
    Author : Okuno Yusuke
     
    Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is the most common neoplasm in children. The MEF2D fusion genes have been identified as a causative chromosomal aberration in ALL. Patients with ALL carrying the MEF2D fusion genes (MEF2D-ALL) have shown resistance to corticosteroid chemotherapy. We performed a global expression analysis of MEF2D-ALL blasts in the presence of corticosteroids and found that intracellular steroid signaling was insufficient to induce cell death. In a fraction of patients with MEF2D-ALL, this insufficiency was caused by a deletion of the NR3C1 steroid receptor gene and/or a deletion of the IKZF1 gene, which are known causes of corticosteroid resistance. In the remaining patients, NR3C1 expression was also significantly decreased. In conclusion, patients carrying MEF2D-ALL have corticosteroid resistance, which was caused by way of a decreased NR3C1 expression.
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    Date (from‐to) : 2017/04 -2020/03 
    Author : Kimura Hiroshi
     
    Chronic active EBV infection (CAEBV) is an intractable disease which is characterized by EBV-infected T/natural killer cells and recurrent/persistent infectious mononucleosis-like symptoms. To clarify the neoplastic nature and pathogenesis of CAEBV, we performed comprehensive genetic analysis in patients with CAEBV. The study revealed that somatic driver mutations were found in EBV-infected cells, suggesting a unique role of these mutations in neoplastic proliferation of EBV-infected cells. Interestingly, the EBV genome harbored frequent intragenic deletions that were common in various EBV-associated lymphomas. Our findings highlight a pathogenic link between intragenic EBV deletions and EBV-associated lymphomagenesis.
  • 新規臨床データと革新的技術の融合で読み解くEBウイルス再活性化
    国立研究開発法人日本医療研究開発機構:国立研究開発法人日本医療研究開発機構 感染症研究革新イニシアティブ(J-PRIDE)
    Date (from‐to) : 2017/04 -2020/03
  • ゲノム不安定性疾患群を中心とした希少難治性疾患の次世代マルチオミクス診断拠点構築
    国立研究開発法人日本医療研究開発機構:国立研究開発法人日本医療研究開発機構 難治性疾患等実用化研究事業
    Date (from‐to) : 2017/04 -2020/03
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    Date (from‐to) : 2017/04 -2019/03 
    Author : Atsushi Narita; TAKAHASHI Yoshiyuki; MURAMATSU Hideki; OKUNO Yusuke; NAKATOCHI Masahiro
     
    We retrospectively studied 57 children with Aplastic anemia (AA) between 1992 and 2010. During the follow‐up, five patients developed clinical PNH, in whom somatic PIGA mutations were detected by targeted sequencing. The 10‐year probability of clinical PNH development was 10.2% (95% CI, 3.6%-20.7%). Furthermore, the detection of minor PNH clones by flow cytometry at AA diagnosis was a risk factor for the subsequent development of clinical PNH. We performed whole-exome sequencing (WES) of paired bone marrow-germline reference samples in 41 patients. WES detected reccurent gene X mutations as a novel mutational target. Gene X mutation may be associated the pahophisiology of AA.
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    Date (from‐to) : 2017/04 -2019/03 
    Author : Suzuki Kyogo; OKUNO Yusuke
     
    MEF2D gene rearrangement (MEF2Dr) is a critical genetic aberration in B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (ALL), which is predominantly observed in adolescent and young adult patients, and confers dismal prognosis. This scientific research aimed to establish diagnostics and provide a clue to the development of novel treatment strategies for this ALL subtype. We performed genetic analyses including direct sequencing and RNA sequencing, and identified three additional MEF2Dr positive cases. MEF2D split fluorescence in situ hybridization analysis showed its diagnostic relevance in detecting MEF2Dr. In a previous study, we demonstrated two molecular targeted drugs, histone deacetylase inhibitor and proteasome inhibitor have antitumor effects against MEF2D-BCL9-positive leukemia cells. Further drug sensitivity testing revealed these drugs possess synergic effect in vitro.
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    Date (from‐to) : 2016/04 -2019/03 
    Author : KAWASHIMA NOZOMU; OKUNO Yusuke; ITO Masafumi
     
    Hemorrhagic cystitis is a severe, intractable complication in children treated with alkylating agents for hematological and solid malignancies or for posttransplant infections, such as BK virus or adenovirus. Choreito, a Japanese Kampo medicine prescription, can significantly shorten the interval from the start of treatment to hemostasis of macroscopic hematuria. Evidence from imaging studies indicates that choreito promotes hemostasis by reducing inflammation in the bladder and perivesical connective tissue. The Kampo pattern also indicates decreased inflammation in the urinary system after taking choreito. Based on the clinical findings, animal models were established to investigate the mechanism of action of choreito. Unfortunately, the hemostatic effects of choreito were not observed, which precluded further investigation of the mechanism.
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    Date (from‐to) : 2016/04 -2018/03 
    Author : Kimura Hiroshi; OKUNO Yusuke
     
    Epstein-Barr virus (EBV) is associated with a variety of intractable infections and malignancies. HAP-1 cells, which have only one genome set, is suitable for genome screening. In this study, we tried screening of host genes to be associated with latency or immortalization of EBV using HAP-1 cells and next generation sequencing. We successfully generated HAP-1/EBV cells, but could not identify any host genes because of the lack in the maintenance of EBV.
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    Date (from‐to) : 2015/04 -2018/03 
    Author : Muramatsu Hideki; OKUNO Yusuke
     
    We analyzed 113 patients with aplastic anemia (AA) in children and identified that absence of PNH-type blood cells and telomere shortening are independent poor prognostic factors for immunosuppressive therapy (IST) reaction (Haematologica 2015). We also identified that patients with high thrombopoietin (TPO) levels showed significantly lower response rate to IST (Pediatr Blood Cancer. 2016). Furthermore, we developed a target sequencing system of 184 genes associated with congenital hematopoietic failure (Genetics in Medicine 2017), and performed on 181 patients with idiopathic AA. In 26 cases, relevant gene mutations were identified, indicating the usefulness of screening for congenital hematopoietic failure genes in pediatric AA patients.
  • 稀少小児遺伝性血液疾患に対する次世代シークエンサーを利用した診断システムの開発に関する研究
    国立研究開発法人日本医療研究開発機構:国立研究開発法人日本医療研究開発機構 革新的な医薬品等の開発を促進させる研究
    Date (from‐to) : 2015/04 -2018/03 
    Author : 小島 勢二
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    Date (from‐to) : 2014/04 -2017/03 
    Author : Hama Asahito; Ogawa Seishi; Okuno Yusuke
     
    To reveal the mechanism of the development from transient abnormal myelopoiesis (TAM) to acute megakaryoblastic leukemia (AMKL) in neonates with Down syndrome (DS), we performed gene mutation analysis for blood of DS neanates using the next generation sequencing. Of 39 neonates with DS, 27 developed TAM. Out of them, 18 (67%) had GATA1 gene mutation in their blood. Out of 30 children with DS-AMKL, 26 (87%) had GATA1 gene mutation. In adiition, JAK3, p53, and RAD21 gene mutations were found in 3 children each.
  • ドナー細胞由来白血病の遺伝学的基盤の解明
    日比野基金:日比野基金 医学研究助成
    Date (from‐to) : 2016/04 -2017/03
  • 次世代シーケンスによる小児急性リンパ性白血病治療成績の改善
    公益財団法人日本対がん協会:公益財団法人日本対がん協会「プロジェクト未来」研究助成
    Date (from‐to) : 2015/10 -2016/10 
    Author : 奥野友介
  • 若年性骨髄単球性白血病の網羅的遺伝子解析に基づく分子標的薬の開発
    科学研究費助成事業
    Date (from‐to) : 2014/04 -2016/03
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    Date (from‐to) : 2014/04 -2016/03 
    Author : Kojima Seiji; OKUNO Yusuke; KATO Taichi
     
    Despite the long history since the discovery of Kawasaki disease, its molecular pathogenesis still remains to be elucidated. In our previous study, we showed that at the very beginning of Kawasaki disease, CD4+CD25+FOXP3+ regulatory T cells were significantly decreased. Additionally, several epidemiological evidence suggets the requirement of infection for the development of Kawasaki disease. Based on these concepts, we hypothesized that an initial infection of unknown pathogen decreases T regulatory cells and the second infection of a common pathogen triggers Kawasaki disease onset. Based on this hypothesis, we planned to perform comprehensive DNA/RNA analysis of clinical specimen obtained before the diagnosis of Kawasaki disease. We successfully collected four clinical specimens obtained before the fulfillment of diagnostic criteria; however, we could not identify any pathogenic genomic sequences among these specimens.
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    Date (from‐to) : 2014/04 -2016/03 
    Author : Kimura Hiroshi; OKUNO Yusuke; ITO Yoshinori; KAWADA Jun-ichi
     
    In hematopoietic stem cell transplantation against children, it is essential to control a variety of viruses that sequentially emerge during transplantation. However, we can detect only small part of the iceberg. To clarify the genomes of all the viruses (so-called “virome”) that inhabit patients with stem cell transplantation, we applied next generation sequencing (NGS) to peripheral blood from transplanted recipients. Peripheral blood was sequentially taken from 4 patients with hematopoietic stem cell transplantation, and comprehensive genome sequencing was performed using MiSeq. From patients’ peripheral blood, TT virus, SEN virus, human herpesvirus 6B, and so on were detected by NGS. Interestingly, dynamics of viral load was correlated with clinical courses in some patients.
  • Japan Society for the Promotion of Science:Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    Date (from‐to) : 2014/04 -2016/03 
    Author : Okuno Yusuke; MURAMATSU Hideki; KOJIMA Seiji
     
    Juvenile myelomonocytic leukemia (JMML) is an intractable hematological disease of childhodd. Despite the treatment with hematopoietic stem cell transplantation, the prognosis is poor. Among the cause of death is a blast criris, of which molecular pathogenesis still remains to be elucidated. In this study, we performed a comprehensive genetic analysis including whole-exome sequencing in three patients with JMML. In a patient whose JMML progressed to a sarcoma, we identified a uniparental disomy event in NRAS, resulting in homozygous activating mutataion. In another patient who developed a mature B-cell leukemia, we identified an acquisition of pathogenic IGH-MYC gene fusion. In the other patient who developed B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia, however, we did not identify any acquired genetic lesions.

Social Contribution

  • ウイルスとは何か:新型コロナウイルスを正しく理解するための基礎知識
    Date (from-to) : 2022/05/27
    Role : Lecturer
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 令和4年度名古屋市立大学オープンカレッジ「コロナを知って、賢く備える8ヶ条」
  • ウイルスや細菌が起こす病気を解決する
    Date (from-to) : 2021/11/03
    Role : Lecturer
    Category : Lecture
    Event, Program, Title : 名古屋市立大学×名古屋市科学館サイエンスパートナーシップイベント「生命の源としくみを探る」
  • ウイルスと研究で戦う(その過程で名古屋市に貢献する)
    Date (from-to) : 2021/10/07
    Role : Lecturer
    Category : Lecture
    Event, Program, Title : PAN倶楽部2022年10月木曜サロン
  • 網羅的遺伝子解析による小児がんの治療成績改善
    Date (from-to) : 2020/02/01
    Role : Appearance
    Sponser, Organizer, Publisher  : NPO法人deleteC
    Event, Program, Title : 2020 -HOPE-
  • 遺伝子解析に基づく小児がん・稀少がんの治療法開発
    Date (from-to) : 2019/10/19
    Role : Appearance
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : リレー・フォー・ライフ・ジャパン 大阪あさひ 2019年度
  • 次世代シーケンスによる 小児急性リンパ性白血病治療成績の改善
    Date (from-to) : 2019/02/04
    Role : Appearance
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 日本対がん協会
    Event, Program, Title : リレー・フォー・ライフ・ジャパン 2019年度 キックオフミーティング
  • 網羅的遺伝子解析に基づく小児がん・稀少がんの治療法開発
    Date (from-to) : 2017/07/01
    Role : Appearance
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋大学
    Event, Program, Title : 平成29年度名古屋大学協力会総会・講演会 がん治療開発の最前線


Copyright © MEDIA FUSION Co.,Ltd. All rights reserved.