韓　龍雲 (ハン　ヨンウン)

研究者情報

科研費研究者番号

• 50566297

J-Global ID

• 201401095496844318

研究分野

• ライフサイエンス / 分子生物学

経歴

• 東京工業大学 生命理工学院研究員
• 京都大学

研究活動情報

論文

• SKP1A bound to Polycomb-silenced genes mediates degradation of PRC2 and preconditions their activation.

  Takashi Kondo; Shinsuke Ito; Junichiro Takano; Yong-Woon Han; Takaho Endo; Kaori Kondo; Marika Shibata; Yusuke Kawashima; Hiroki Sugishita; Mio Harachi; Jafar Sharif; Jun Seita; Osamu Ohara; Manabu Nakayama; Haruhiko Koseki

  Molecular cell 85 17 3306 - 3320 2025年09月
• SINE retrotransposons link replication timing with higher-order genome organization by recruiting H2B monoubiquitination to the gene body

  Jafar Sharif; Meiji Ma; Ryo Onishi; kayoko Katsuyama; Shu-Lan Sun; Yoko Mizutani-Koseki; Yong-Woon Han; Masashi Matsuda; Manabu Nakayama; Haruhiko Koseki

  2025年08月
• Tetraspanin7 in adipose tissue remodeling and its impact on metabolic health.

  Shino Nemoto; Kazuyo Uchida; Tetsuya Kubota; Manabu Nakayama; Yong-Woon Han; Shigeo Koyasu; Hiroshi Ohno

  Molecular metabolism 97 102168 - 102168 2025年07月
• Mapping adipocyte interactome networks by HaloTag-enrichment-mass spectrometry

  Junshi Yazaki; Takashi Yamanashi; Shino Nemoto; Atsuo Kobayashi; Yong-Woon Han; Tomoko Hasegawa; Akira Iwase; Masaki Ishikawa; Ryo Konno; Koshi Imami; Yusuke Kawashima; Jun Seita

  Biology Methods and Protocols 9 1 bpae039  2024年01月
• PCGF1-PRC1 links chromatin repression with DNA replication during hematopoietic cell lineage commitment.

  Junichiro Takano; Shinsuke Ito; Yixing Dong; Jafar Sharif; Yaeko Nakajima-Takagi; Taichi Umeyama; Yong-Woon Han; Kyoichi Isono; Takashi Kondo; Yusuke Iizuka; Tomohiro Miyai; Yoko Koseki; Mika Ikegaya; Mizuki Sakihara; Manabu Nakayama; Osamu Ohara; Yoshinori Hasegawa; Kosuke Hashimoto; Erik Arner; Robert J Klose; Atsushi Iwama; Haruhiko Koseki; Tomokatsu Ikawa

  Nature communications 13 1 7159 - 7159 2022年11月
• Homology length dictates the requirement for Rad51 and Rad52 in gene targeting in the Basidiomycota yeast Naganishia liquefaciens.

  Maierdan Palihati; Hideo Tsubouchi; Bilge Argunhan; Rei Kajitani; Omirgul Bakenova; Yong-Woon Han; Yasuto Murayama; Takehiko Itoh; Hiroshi Iwasaki

  Current genetics 67 6 919 - 936 2021年12月
• Cooperative recruitment of RDR6 by SGS3 and SDE5 during small interfering RNA amplification in Arabidopsis.

  Manabu Yoshikawa; Yong-Woon Han; Hirofumi Fujii; Shu Aizawa; Tatsuya Nishino; Masayuki Ishikawa

  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118 34 2021年08月
• Draft Genome Sequence of Naganishia liquefaciens Strain N6, Isolated from the Japan Trench.

  Yong-Woon Han; Rei Kajitani; Hiroya Morimoto; Maierdan Palihati; Yumiko Kurokawa; Rie Ryusui; Bilge Argunhan; Hideo Tsubouchi; Fumiyoshi Abe; Susumu Kajiwara; Hiroshi Iwasaki; Takehiko Itoh

  Microbiology resource announcements 9 47 2020年11月
• Preferential 5-Methylcytosine Oxidation in the Linker Region of Reconstituted Positioned Nucleosomes by Tet1 Protein.

  Seiichiro Kizaki; Tingting Zou; Yue Li; Yong-Woon Han; Yuki Suzuki; Yoaahie Harada; Hiroshi Sugiyama

  Chemistry 22 46 16598 - 16601 2016年11月 [査読有り]
  
• Impeller entrance pre whirl characteristics research

  W. Wu; Y. Wang; Y. W. Han

  7TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON PUMPS AND FANS (ICPF2015) 129 2016年 [査読有り]
  
• The application of fluorescence-conjugated pyrrole/imidazole polyamides in the characterization of protein-DNA complex formation.

  Yong-Woon Han; Hiroshi Sugiyama; Yoshie Harada

  Biomaterials science 4 3 391 - 9 2016年01月 [査読有り]
  
• Synergistic effect of ATP for RuvA-RuvB-Holliday junction DNA complex formation

  Takuma Iwasa; Yong-Woon Han; Ryo Hiramatsu; Hiroaki Yokota; Kimiko Nakao; Ryuji Yokokawa; Teruo Ono; Yoshie Harada

  SCIENTIFIC REPORTS 5 18177 - 18177 NATURE PUBLISHING GROUP 2015年12月 [査読有り]
  
• ECHO-liveFISH: in vivo RNA labeling reveals dynamic regulation of nuclear RNA foci in living tissues.

  Ikumi Oomoto; Asuka Suzuki-Hirano; Hiroki Umeshima; Yong-Woon Han; Hiroyuki Yanagisawa; Peter Carlton; Yoshie Harada; Mineko Kengaku; Akimitsu Okamoto; Tomomi Shimogori; Dan Ohtan Wang

  Nucleic acids research 43 19 e126  2015年06月
• 蛍光標識したSRAを用いた半メチル化CpGメチル化過程の特性分析

  Cui Yubing; Han Yong-Woon; Ariyoshi Mariko; Arita Kyohei; Suetake Isao; Tajima Shoji; Harada Yoshie

  生物物理 54 Suppl.1-2 S268 - S268 2014年08月
• ナノ開口基板を用いたDNAメチル化パターン維持機構に関与する生体分子の機能解析

  韓 龍雲; 原田 慶恵

  生体の科学 65 6 553 - 558 2014年06月 [査読有り]
  
• 2P118 哺乳類ヌクレオチド除去修復タンパク質XPCのDNA結合モードの1分子イメージング(04. 核酸結合蛋白質,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

  Yokota Hiroaki; Tone Daisuke; Han Yong-Woon; Harada Yoshie; Sugasawa Kaoru

  生物物理 54 1 S214  一般社団法人 日本生物物理学会 2014年
• Construction and characterization of Cy3-or Cy5-conjugated hairpin pyrrole-imidazole polyamides binding to DNA in the nucleosome

  Yong-Woon Han; Yasuo Tsunaka; Hiroaki Yokota; Tomoko Matsumoto; Gengo Kashiwazaki; Hironobu Morinaga; Kaori Hashiya; Toshikazu Bando; Hiroshi Sugiyama; Yoshie Harada

  BIOMATERIALS SCIENCE 2 3 297 - 307 2014年 [査読有り]
  
• Effect of single pyrrole replacement with β-alanine on DNA binding affinity and sequence specificity of hairpin pyrrole/imidazole polyamides targeting 5′-GCGC-3′

  Yong-Woon Han; Gengo Kashiwazaki; Hironobu Morinaga; Tomoko Matsumoto; Kaori Hashiya; Toshikazu Bando; Yoshie Harada; Hiroshi Sugiyama

  Bioorganic and Medicinal Chemistry 21 17 5436 - 5441 2013年09月 [査読有り]
  
• In Vivo Fluorescent Adenosine 5'-Triphosphate (ATP) Imaging of Drosophila melanogaster and Caenorhabditis elegans by Using a Genetically Encoded Fluorescent ATP Biosensor Optimized for Low Temperatures

  Taiichi Tsuyama; Jun-ichi Kishikawa; Yong-Woon Han; Yoshie Harada; Asako Tsubouchi; Hiroyuki Noji; Akira Kakizuka; Ken Yokoyama; Tadashi Uemura; Hiromi Imamura

  ANALYTICAL CHEMISTRY 85 16 7889 - 7896 2013年08月 [査読有り]
  
• ParA-mediated plasmid partition driven by protein pattern self-organization

  Ling Chin Hwang; Anthony G. Vecchiarelli; Yong-Woon Han; Michiyo Mizuuchi; Yoshie Harada; Barbara E. Funnell; Kiyoshi Mizuuchi

  EMBO Journal 32 9 1238 - 1249 2013年05月 [査読有り]
  
• 2P117 哺乳類ヌクレオチド除去修復タンパク質XPCの1分子イメージング(04.核酸結合蛋白質,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

  Yokota Hiroaki; Tone Daisuke; Han Yong-Woon; Harada Yoshie; Sugasawa Kaoru

  生物物理 53 1 S178  一般社団法人 日本生物物理学会 2013年
• 2P119 ナノ開口を用いた1分子イメージングによるRuvB多量体形成機構の解明(04.核酸結合蛋白質,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

  Iwasa Takuma; Han Yong-Woon; Yokota Hiroaki; Yokokawa Ryuji; Hiramatsu Ryo; Ono Teruo; Harada Yoshie

  生物物理 53 1 S178  一般社団法人 日本生物物理学会 2013年
• Characterization of SRA-Methylated DNA Complexes Dynamics Related to Chromatin Structure Regulation

  Yong-Woon Han; Hiroaki Yokota; Mariko Ariyoshi; Yasuo Tsunaka; Takuma Iwasa; Ryuji Yokokawa; Ryo Hiramatsu; Daichi Chiba; Teruo Ono; Yoshie Harada

  BIOPHYSICAL JOURNAL 104 2 255A  2013年01月 [査読有り]
  
• Binding of hairpin pyrrole and imidazole polyamides to DNA: relationship between torsion angle and association rate constants

  Yong-Woon Han; Tomoko Matsumoto; Hiroaki Yokota; Gengo Kashiwazaki; Hironobu Morinaga; Kaori Hashiya; Toshikazu Bando; Yoshie Harada; Hiroshi Sugiyama

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH 40 22 11510 - 11517 2012年12月 [査読有り]
  
• 1SD-01 Characterization of Protein-DNA complexes dynamics related to Chromatin structure regulation using Single-Molecule Techniques(1SD Molecular Dynamics in the Nucleus and Gene Regulation,Symposium,The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

  韓 龍雲; Harada Yoshie

  生物物理 52 S4  一般社団法人 日本生物物理学会 2012年
• 1M1548 P46 ナノ開口によるAAA^+ DNA組換えATPaseの1分子イメージング : 6量体形成過程の解明に向けて(分子モーター2,第49回日本生物物理学会年会)

  Iwasa Takuma; Han Yongwoon; Yokota Hiroaki; Yokokawa Ryuji; harada Yoshie

  生物物理 51 S65  一般社団法人 日本生物物理学会 2011年
• 1C1548 Direct observation of P1 plasmid movement on an optical microscope(Nucleic acid,The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

  Han Yong-Woon; Hwang Ling-Chin; Vecchiarelli Anthony G.; Mizuuchi Michiyo; Funnell Barbara E.; Harada Yoshie; Mizuuchi Kiyoshi

  生物物理 51 S35 - S36 一般社団法人 日本生物物理学会 2011年
• ATP control of dynamic P1 ParA-DNA interactions: a key role for the nucleoid in plasmid partition

  Anthony G. Vecchiarelli; Yong-Woon Han; Xin Tan; Michiyo Mizuuchi; Rodolfo Ghirlando; Christian Biertuempfel; Barbara E. Funnell; Kiyoshi Mizuuchi

  MOLECULAR MICROBIOLOGY 78 1 78 - 91 2010年10月 [査読有り]
  
• Phage Mu Transposition Immunity: Protein Pattern Formation along DNA by a Diffusion-Ratchet Mechanism

  Yong-Woon Han; Kiyoshi Mizuuchi

  MOLECULAR CELL 39 1 48 - 58 2010年07月 [査読有り]
  
• 1P125 Fixed interaction between the Escherichia coli RuvA and RuvB proteins during branch migration of Holliday junction(Nucleic acid binding proteins,The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

  Han YongWoon; Yokota Hiroaki; Hishida Takashi; Iwasaki Hiroshi; Hayashi Masahito; Shinagawa Hideo; Harada Yoshie

  生物物理 50 2 S41  一般社団法人 日本生物物理学会 2010年
• Single-molecule Visualization of Binding Modes of Helicase to DNA on PEGylated Surfaces

  Hiroaki Yokota; Yong-Woon Han; Jean-Francois Allemand; Xu Guang Xi; David Bensimon; Vincent Croquette; Yoshihiro Ito; Yoshie Harada

  CHEMISTRY LETTERS 38 4 308 - 309 2009年04月 [査読有り]
  
• 2P-331 同時計測顕微鏡によるDNA-ヘリカーゼ相互作用の1分子観察(バイオイメージング(1),第46回日本生物物理学会年会)

  Yokota Hiroaki; Han Yong-Woon; Allemand Jean-Francois; Xi Xuguang; Croquette Vincent; Bensimon David; Harada Yoshie

  生物物理 48 S126  一般社団法人 日本生物物理学会 2008年
• 3P320 同時計測顕微鏡によるDNA/ヘリカーゼ相互作用の1分子観察(バイオイメージング、行動、発生・分化、分子遺伝、その他,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)

  横田 浩章; 韓 龍雲; Allemand Jean-Francois; Xuguang Xi; Vincent Croquette; Bensimon David; 原田 慶恵

  生物物理 47 S283  一般社団法人 日本生物物理学会 2007年
• 1P556 Novel microscopy for simultaneous single molecule measurement of DNA/protein interaction(26. Single molecule biophysics,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

  Yokota Hiroaki; Han Yong-Woon; Allemand Jean-Francois; Xi Xugang; Croquette Vincent; Bensimon David; Harada Yoshie

  生物物理 46 2 S285  一般社団法人 日本生物物理学会 2006年
• Functional overlap between RecA and MgsA (RarA) in the rescue of stalled replication forks in Escherichia coli

  T Shibata; T Hishida; Y Kubota; YW Han; H Iwasaki; H Shinagawa

  GENES TO CELLS 10 3 181 - 191 2005年03月 [査読有り]
  
• 1P128 Holliday構造DNA分岐点移動反応に関与するRuvA-RuvB蛋白質複合体の動力学的解析(核酸結合蛋白質))

  韓 龍霊; 谷 知己; 林 真人; 横田 浩章; 菱田 卓; 岩崎 博史; 品川 日出夫; 原田 慶恵

  生物物理 45 S63  一般社団法人 日本生物物理学会 2005年
• 1P327 1分子力学/蛍光同時計測顕微鏡の開発II(バイオイメージング))

  横田 浩章; 韓 龍雲; Allemand Jean-Francois; Xi Xueuang; Croquette Vincent; Bensimon David; 原田 慶恵

  生物物理 45 S113  一般社団法人 日本生物物理学会 2005年
• Role of the Escherichia coli RecQ DNA helicase in SOS signaling and genome stabilization at stalled replication forks

  T Hishida; YW Han; T Shibata; Y Kubota; Y Ishino; H Iwasaki; H Shinagawa

  GENES & DEVELOPMENT 18 15 1886 - 1897 2004年08月 [査読有り]
  
• 2P097 一分子解析法を用いたRuvA-RuvB蛋白質複合体のHolliday構造DNA分岐点移動反応の直接観察(核酸結合蛋白質)

  韓 龍雲; 谷 知己; 林 真人; 菱田 卓; 岩崎 博史; 品川 日出夫; 原田 慶恵

  生物物理 44 S134  一般社団法人 日本生物物理学会 2004年
• Uncoupling of the ATPase activity from the branch migration activity of RuvAB protein complexes containing both wild-type and ATPase-defective RuvB proteins

  T Hishida; H Iwasaki; YW Han; T Ohnishi; H Shinagawa

  GENES TO CELLS 8 9 721 - 730 2003年09月 [査読有り]
  
• A unique beta-hairpin protruding from AAA(+) ATPase domain of RuvB motor protein is involved in the interaction with RuvA DNA recognition protein for branch migration of Holliday junctions

  YW Han; H Iwasaki; T Miyata; K Mayanagi; K Yamada; K Morikawa; H Shinagawa

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 276 37 35024 - 35028 2001年09月 [査読有り]
  
• Mutational analysis of the functional motifs of RuvB, an AAA(+) class helicase and motor protein for Holliday junction branch migration

  H Iwasaki; YW Han; T Okamoto; T Ohnishi; M Yoshikawa; K Yamada; T Toh; H Daiyasu; T Ogura; H Shinagawa

  MOLECULAR MICROBIOLOGY 36 3 528 - 538 2000年05月 [査読有り]
  

MISC

• メチル化CpG維持に関与するSRAドメインの機能解析

  韓龍雲; 崔玉兵; 崔玉兵; 横田浩章; 横田浩章; 有吉眞理子; 津中康央; 有田恭平; 安里慧; 安里慧; 岩佐拓磨; 岩佐拓磨; 平松亮; 横川隆司; 小野輝男; 原田慶恵; 原田慶恵 日本生化学会大会(Web) 88th 2P0658 (WEB ONLY) -[2P0658] 2015年12月
• 蛍光標識ヌクレオソームを用いたクロマチン再構成複合体の機能解析(Characterization of ATP-dependent chromatin remodeling complexes using fluorescently labeled nucleosome)

  Han Yong-Woon; Tsunaka Yasuo; Yokota Hiroaki; Yamada Kazuhiro; Ohnishi Mai; Yamazaki Sayaka; Suetake Isao; Tajima Shoji; Tadakuma Hisashi; Harada Yoshie 生物物理 54 (Suppl.1-2) S268 -S268 2014年08月
• Construction and Characterization of Cy3-or Cy5-Conjugated Hairpin Pyrrole/Imidazole Polyamides Binding to DNA in the Nucleosome

  Han Yong-Woon; Matsumoto Tomoko; Yokota Hiroaki; Tsunaka Yasuo; Kashiwazaki Gengo; Morinaga Hironobu; Hashiya Kaori; Bando Toshikazu; Sugiyama Hiroshi; Harada Yoshie BIOPHYSICAL JOURNAL 106 (2) 693A 2014年01月 [査読有り]
  
• Single-Molecule Visualization of Ruvb Origomer for Charactorizing a AAA(+) Class Hexameric Atpase with Zero-Mode Waveguides

  Takuma Iwasa; Yong-Woon Han; Hiroaki Yokota; Ryuji Yokokawa; Teruo Ono; Ryo Hiramatsu; Yoshie Harada BIOPHYSICAL JOURNAL 106 (2) 690A -690A 2014年01月
• 3P120 蛍光標識ヌクレオソームを用いたクロマチン再構成複合体の機能解析(04. 核酸結合蛋白質,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

  Han Yong-Woon; Harada Yoshie; Tsunaka Yasuo; Yokota Hiroaki; Yamada Kazuhiro; Ohnishi Mai; Yamazaki Sayaka; Suetake Isao; Tajima Shoji; Tadakuma Hisashi 生物物理 54 (1) S268 2014年
• ナノ開口基板を用いたヘミメチルCpG認識に関与するSRA-DNA複合体の機能解析(Characterization of SRA-DNA complex using Zero mode waveguides)

  Han Yong-Woon; Yokota Hiroaki; Ariyoshi Mariko; Tsunaka Yasuo; Iwasa Takuma; Yokokawa Ryuji; Hiramatsu Ryo; Chiba Daichi; Ono Teruo; Harada Yoshie 生物物理 53 (Suppl.1-2) S178 -S178 2013年09月
• MuB is an AAA+ ATPase that forms helical filaments to control target selection for DNA transposition

  Naoko Mizuno; Marija Dramicánin; Michiyo Mizuuchi; Julia Adam; Yi Wang; Yong-Woon Han; Wei Yang; Alasdair C. Steven; Kiyoshi Mizuuchi; Santiago Ramoń-Maiques Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 110 (27) E2441 -E2450 2013年07月 [査読有り]
  
• 2P118 ナノ開口基板を用いたヘミメチルCpG認識に関与するSRA-DNA複合体の機能解析(04.核酸結合蛋白質,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

  Han Yong-Woon; Harada Yoshie; Yokota Hiroaki; Ariyoshi Mariko; Tsunaka Yasuo; Iwasa Takuma; Yokokawa Ryuji; Hiramatsu Ryo; Chiba Daichi; Ono Teruo 生物物理 53 (1) S178 2013年
• ヘミメチルCpG認識に関与するSRAドメインの機能解析

  韓龍雲; 横田浩章; 有吉真理子; 津中康央; 有田恭平; 岩佐拓磨; 横川隆司; 平松亮; 千葉大地; 小野輝男; 原田慶恵 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 1P-0233 (WEB ONLY) 2013年
• Dynamic Self-Organization of Bacterial DNA Segregation Machinery in a Cell-Free Reaction

  Ling Chin Hwang; Yong-Woon Han; Anthony G. Vecchiarelli; Yoshie Harada; Barbara E. Funnell; Kiyoshi Mizuuchi BIOPHYSICAL JOURNAL 102 (3) 381A -381A 2012年01月
• DNA Unwinding Mechanism by Escherichia Coli ReCQ: Implications for DNA Replication

  Yong-Woon Han; Hiroaki Yokota; Yoshie Harada BIOPHYSICAL JOURNAL 100 (3) 241 -241 2011年02月
• Biochemical Analysis of RuvA-RuvB Complex Formation During Branch Migration of Holliday Junction DNA

  Yong-Woon Han; Hiroaki Yokota; Takashi Hishida; Hiroshi Iwasaki; Masahito Hayashi; Hideo Shinagawa; Yoshie Harada BIOPHYSICAL JOURNAL 98 (3) 65A -65A 2010年01月
• Direct observation of DNA rotation during branch migration of Holliday junction DNA by Escherichia coli RuvA-RuvB protein complex

  Yong-Woon Han; Tomomi Tani; Masahito Hayashi; Takashi Hishida; Hiroshi Iwasaki; Hideo Shinagawa; Yoshie Harada PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 103 (31) 11544 -11548 2006年08月 [査読有り]
  
• Direct evidence that a conserved arginine in RuvB AAA(+) ATPase acts as an allosteric effector for the ATPase activity of the adjacent subunit in a hexamer

  T Hishida; YW Han; S Fujimoto; H Iwasaki; H Shinagawa PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 101 (26) 9573 -9577 2004年06月 [査読有り]
  

共同研究・競争的資金等の研究課題

• 植物病原体サプレッサーによるＲＮＡサイレンシング阻害機構の解明

  日本学術振興会：科学研究費助成事業

  研究期間 : 2023年04月 -2027年03月 

  代表者 : 吉川 学; 韓 龍雲; 岩川 弘宙; 向原 隆文

   

  これまでの植物のRNAサイレンシングに関する研究によって、詳細な分子機構やウイルスに対する抵抗性における機能などが明らかにされてきた。近年、ウイルス以外にも、細菌やカビ、卵菌など広範な植物病原微生物に対する防御機構の一つとしてRNAサイレンシングが機能することが示唆されている。一方、それらの植物病原微生物やウイルスは、宿主のRNAサイレンシングを阻害するサプレッサーと呼ばれるタンパク質を有している。我々は、試験管内で植物のRNAサイレンシングを解析できる実験系を構築し、その分子機構を解析してきた。本研究ではこの実験系を用いて、植物病原微生物に由来するサプレッサーによるRNAサイレンシング抑制機構を明らかにすることを目的とする。 まず本研究では、様々な植物病原体に由来する既存サプレッサーによるRNAサイレンシング阻害の作用機作を試験管内実験系で解析し、分子レベルでの解明する。また植物病害細菌のエフェクターから宿主RNAサイレンシングを抑制するタンパク質を探索する。そのためにエフェクター遺伝子ライブラリーを準備して試験管内転写反応によりmRNAを作製した。次に試験管内翻訳反応でそれらのエフェクタータンパク質を調製した後、試験管内RNAサイレンシング実験系で阻害効果を調べる。阻害効果が確認できたエフェクターについては、阻害するステップの解析や質量分析などにより相互作用する宿主タンパク質を同定するなどの解析を行う。以上の研究を行い、様々な作物に植物病原微生物抵抗性の付与に繋がる知見を得ることを目指す。
• 植物病原体サプレッサーによるＲＮＡサイレンシング阻害機構の解明

  日本学術振興会：科学研究費助成事業

  研究期間 : 2023年04月 -2027年03月 

  代表者 : 吉川 学; 韓 龍雲; 岩川 弘宙; 向原 隆文
• ＳＧＳ３と協調してＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼを活性化するＳＤＥ５の機能解明

  日本学術振興会：科学研究費助成事業

  研究期間 : 2018年04月 -2021年03月 

  代表者 : 吉川 学; 西野 達哉; 韓 龍雲

   

  植物には小分子RNAとAGRONAUTEを含む複合体RISCによって切断されたRNAを鋳型に二本鎖RNAが合成され、それをDICER-LIKEが切断し、新生siRNA(二次的siRNAと呼ばれる)を生成するRNAサイレンシング増幅機構がある。この機構は内在性の二次的siRNAであるtrans-acting siRNA生成やウイルス防御に機能する。本研究課題では、RNAサイレンシング増幅機構過程において、SGS3とSDE5が協調してRDR6を呼び込み二本鎖RNAが合成されることを明らかにした。
• ナノ開口による転写反応の分子機構の解析

  日本学術振興会：科学研究費助成事業

  研究期間 : 2017年06月 -2019年03月 

  代表者 : 原田 慶恵; 多田隈 尚史; 中尾 公子; 韓 龍雲; 福本 紘大; 増渕 岳也

   

  転写は遺伝子発現の最初の機構であり、非常に重要である。本研究では、リアルタイムの転写可視化を目指して、その基盤技術である、ナノ開口法の改良を行った。その結果、基板作製手順や、表面処理の最適化を行い、基板間のバラつきを抑えることに成功した。また、転写では、レール(DNA)が3次元で折れ曲がるので、その上を運動する酵素(RNAポリメラーゼ)や、制御因子の3次元的な空間配置や、その結果引き起こされる相互作用の強弱が重要であるが、DNAナノ構造を用いることで、ナノメートル精度で転写関連因子の空間配置を制御する基盤技術を確立した。
• 低コスト・高効率な新規ナノ開口基板作製法の開発とDNA結合蛋白質研究への応用

  日本学術振興会：科学研究費助成事業

  研究期間 : 2016年04月 -2019年03月 

  代表者 : 韓 龍雲

   

  高濃度蛍光標識生体分子の蛍光１分子イメージングを可能とするナノ開口基板は解離定数の高い蛋白質―蛋白質間や蛋白質―DNA間の結合解離の様子を詳細に解析することが可能である。これまでに私も自身でナノ開口基板作製手法を確立し、DNA結合蛋白質の機能解析を行ってきた。しかしながら、ナノ開口基板を用いた研究手法を汎用性の高い研究手法とするためには、ナノ開口基板を安価で効率よく作製する必要があり、本研究では、Character Projection法と呼ばれる電子線描画法を利用して、これまでの自身の手法に比べて、作製コストを1/5に、作製効率を10倍にすることに成功した。
• 新規一分子計測のためのガラス基板の作製とDNA結合蛋白質研究への応用

  日本学術振興会：科学研究費助成事業

  研究期間 : 2013年04月 -2016年03月 

  代表者 : 韓 龍雲; 岩佐 拓磨

   

  高濃度蛍光標識生体分子を１分子レベルで結合解離の様子を観察・解析可能なナノ開口基板を用いて、大腸菌のHolliday構造DNAの分岐点移動を促進するモーター蛋白質であるRuvBの機能解析やエピジェネティック制御、特にメチル化DNA維持機構に大きく関与するヘミメチルCpG結合ドメインであるSRAの機能解析を中心に研究を進めました。RuvB蛋白質についてはADPやATPγS等の様々なヌクレオチド存在下でRuvBとRuvA-Holliday構造DNAとの相互作用を解析した結果、RuvBの６量体形成は、ATPとの結合だけでなく、ATP加水分解により促進することを示唆する結果を得ました。
• 一分子計測法による複製フォークDNA特異的モーター蛋白質の機能解析

  日本学術振興会：科学研究費助成事業

  研究期間 : 2011年 -2012年 

  代表者 : 韓 龍雲; 岩佐 拓磨

   

  高精度で蛋白質やDNAの動きを計測、制御できる一分子計測技術を用いて、大腸菌のUvrDというDNAヘリケースやHolliday構造DNAの分岐点移動を促進するモーター蛋白質であるRuvBの機能解析を行った。 またDNA塩基配列特異的にDNAと相互作用する小化合物Pyrrole-Imidazole polyamideの構造とDNAに対する結合解離速度との関連性を明らかにすることに成功しました。

その他のリンク

researchmap

https://researchmap.jp/7000008817