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Advance

YUKAWA Yasushi

    Graduate School of Science Division of Biological Science　Professor
Contact： yyuknsc.nagoya-cu.ac.jp
Last Updated :2024/04/24

Researcher Information

Degree

  • Ph. D.（Nagoya University）

URL

Research funding number

  • 70381902

ORCID ID

J-Global ID

Research Interests

  • genome editing   U snRNA   defense   chromatin   Arabidopsis   stress response   in vitro translation   transcriptional regulation   RNA polymerase III   tRNA   in vitro transcription   non-coding RNA   遺伝子発現制御   RNA 生物学   植物分子生物学   

Research Areas

  • Life sciences / Genomics
  • Life sciences / Molecular biology
  • Life sciences / Plants: molecular biology and physiology

Academic & Professional Experience

  • 2020/04 - Today  Nagoya City UniversityGraduate School of ScienceProfessor
  • 2010/04 - 2020/03  Nagoya City UniversityGraduate School of Natural SciencesProfessor
  • 2006/04 - 2017/03  Nagoya City UniversityGraduate School of Natural SciencesAssistant Professor
  • 2008/04 - 2010/03  Nagoya City UniversityGraduate School of Natural SciencesAssociate Professor
  • 2005/04 - 2006/03  Nagoya City UniversityGraduate School of Natural SciencesSenior Lecturer
  • 2001/11 - 2005/03  Nagoya City UniversityInstitute of Natural SciencesResearcher
  • 1998/11 - 2001/10  Nagoya UniversityCenter for Gene ResearchJSPS, Research Fellowship for Young Scientists
  • 2000/07 - 2000/09  Julius-Maximilians-Univesität Würzburg,Institut für BiochemieVisiting Researcher
  • 1999/08 - 1999/08  Julius-Maximilians-Univesität Würzburg,Institut für BiochemieVisiting Researcher
  • 1998/04 - 1998/10  Nagoya UniversityCenter for Gene Research, Nagoya UniversityResearcher

Education

  • 1995/04 - 1998/03  Nagoya University  Doctoral Program, Graduate School of Science  Division of Biology
  • 1993/04 - 1995/04  Toyama University  Master's Course, Graduate School of Science  Division of Biology
  • 1989/04 - 1993/03  Toyama University  Faculty of Science  Department of Biology

Association Memberships

  • The Japanese Society of Plant Physiologists   The Molecuar Biology Society of Japan   

Published Papers

MISC

Research Grants & Projects

  • 日本学術振興会：基盤研究(C)
    Date (from‐to) : 2019/04 -2022/03 
    Author : 湯川 泰
     
    細胞中には多様な非コードRNAが存在し、200 塩基を超える長鎖非コード RNAの機能解明は進んでいない。260塩基長のAtR8 lncRNAは、RNAポリメラーゼIIIの転写プロモーターに着目することでシロイヌナズナから発見され、以下の特徴がある。１．タンパク質と結合し、細胞質に大量に存在する。２．感染、ストレス、サリチル酸に応答する。３．根と未熟種子に局在する。本研究はAtR8 lncRNAの結合タンパク質を同定することで、その感染防御の機能を解明する。
  • Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2009 -2011 
    Author : TOZAWA Yuzuru; YUKAWA Yasushi; NOMURA Yuhta
     
    Chloroplasts are derived from symbiosis of photosynthetic bacteria, and have ppGpp-mediated signal transduction system. In order to clarify the functional roles of ppGpp-signal in chloroplasts, we have investigated functions of ppGpp in the protein synthesis. Here we have established in vitro translation system based on extracts of isolated pea chloroplasts, and demonstrated that ppGpp directly regulates protein synthesis activity of chloroplasts in vitro.
  • 日本学術振興会：新学術領域研究（研究課題提案型）
    Date (from‐to) : 2008 -2010 
    Author : 中平 洋一; 湯川 泰
  • 日本学術振興会：基盤研究(C)
    Date (from‐to) : 2008 -2010 
    Author : 湯川 泰
     
    シロイヌナズナ培養細胞で成長の速いMM2d株を材料に、無細胞転写解析系を確立した。MM2d細胞は通常の暗条件下での培養で黄化下細胞となるが、光を当てて培養することにより緑化した細胞を調製することができる。そこで、それぞれの細胞から細胞核を単離し、無細胞転写解析系を作成した。明培養および暗培養由来の無細胞系をもちいて、シロイヌナズナの光合成遺伝子であるリブロース1,5-ビスリン酸カルボキシラーゼ/オキシゲナーゼ(rbcS)遺伝子の光依存転写制御を解析することに成功した。
  • Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2005 -2006 
    Author : SUGIURA Masahiro; YUKAWA Yasushi; NAKAMURA Masayuki; KURODA Hiroshi
     
    1. RNA editing sites (1) Two additional sites were identified in the ndhD mRNA from tobacco (N. tabacum) chloroplasts. The total number of sites is thus 38, the most so far found in higher plant chloroplasts. (2) ACG to AUG RNA editing in ndhD mRNAs from tobacco progenitors (N sylvestris and N. tomentosiformis) was reexamined, and this editing in the latter species occurred depending on culture conditions. 2. Improvement of the in vitro RNA editing assay A rapid and simple in vitro assay was established using fluorescent dideoxynucleotides. 3. Cis-elements for RNA editing Using the above assay, editing activities of 19 sites in five tobacco ndh mRNA species were measured. A cis-element in the ndhB mRNA was defined to be 5 nucleotides (nt) from-6 to-10, whereas ndhF mRNAs have two separate cis-elements, 15 nt from-1 to-15 and 5 nt from-36 to-40. 4. Trans-factors Using fuorescent mRNAs, a method to detect trans-factors for editing was tried. 5. Analysis of site-recognition factors The 56 kD trans-factor for psbE mRNA editing was isolated, and its partial amino acid sequences were determined. No similar sequence was found in databases.
  • 日本学術振興会：特別研究員奨励費
    Date (from‐to) : 1999 -2001 
    Author : 湯川 泰

Teaching Experience

  • Plant PhysiologyPlant Physiology Nagoya City University, School of Biology and Integrated Sciences
  • Molecular Biology IMolecular Biology I Nagoya City University, School of Biology and Integrated Sciences

Social Contribution

  • 名古屋市立大学×名古屋市博物館サイエンスパートナーシップイベント
    Date (from-to) : 2021/11/03
    Role : Presenter
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学、名古屋市博物館
    Event, Program, Title : 生命の源としくみを探る
    名古屋市科学館 名古屋市立大学と名古屋市科学館は、次世代の科学系・技術系人材の育成と地域社会の発展を目指し、平成28年3月にサイエンスパートナーシップを締結しました。名古屋市立大学の理系教員と名古屋市科学館の学芸員が「生命科学」の魅力を伝えるとともに、研究者や学芸員との交流を通じて、名市大での最先端研究や科学館の魅力を紹介します。
  • 名古屋市立大学×名古屋市博物館サイエンスパートナーシップイベント
    Date (from-to) : 2019/11/04
    Role : Planner
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学、名古屋市科学館
    Event, Program, Title : 生命科学と化学の融合
    名古屋市科学館 名古屋市立大学と名古屋市科学館は、次世代の科学系・技術系人材の育成と地域社会の発展を目指し、平成28年3月にサイエンスパートナーシップを締結しました。名古屋市立大学の理系教員と名古屋市科学館の学芸員が「生命科学」の魅力を伝えるとともに、研究者や学芸員との交流を通じて、名市大での最先端研究や科学館の魅力を紹介します。
  • Date (from-to) : 2019/10/26-2019/10/27
    Role : Planner
    Category : Others
    Sponser, Organizer, Publisher  : 大阪市立大学、名古屋市立大学、横浜市立大学、読売新聞社
    High school students
  • Date (from-to) : 2018/12/14
    Role : Lecturer
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 東海農政局
    Event, Program, Title : 食品安全セミナー
  • Date (from-to) : 2018/12/09
    Role : Planner
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学、名古屋市科学館
    Event, Program, Title : 総合生命理学部設置記念 生命科学研究への扉
    名古屋市科学館 名古屋市立大学と名古屋市科学館は、次世代の科学系・技術系人材の育成と地域社会の発展を目指し、平成28年3月にサイエンスパートナーシップを締結しました。名古屋市立大学の理系教員と名古屋市科学館の学芸員が「生命科学」の魅力を伝えるとともに、研究者や学芸員との交流を通じて、名市大での最先端研究や科学館の魅力を紹介しました。
  • Date (from-to) : 2018/10/27-2018/10/28
    Role : Planner
    Category : Others
    Sponser, Organizer, Publisher  : 大阪市立大学・名古屋市立大学・横浜市立大学・読売新聞社
    Event, Program, Title : 第15回高校化学グランドコンテスト
    High school students
  • Date (from-to) : 2018/02/28
    Role : Lecturer
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 東海農政局
    Event, Program, Title : 食品安全セミナー
  • Date (from-to) : 2018/01/19
    Role : Lecturer
    Category : Science cafe
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学システム自然科学研究科
    Event, Program, Title : 第128回 サイエンスカフェ イン 名古屋
  • Date (from-to) : 2017/10/28-2017/10/29
    Role : Planner
    Category : Others
    Sponser, Organizer, Publisher  : 大阪位市立大学・名古屋市立大学・横浜市立大学・読売新聞社
    Event, Program, Title : 第14回高校化学グランドコンテスト
    High school students
  • Date (from-to) : 2017/09/02
    Role : Planner
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学、名古屋市科学館
    Event, Program, Title : ようこそ生命科学の世界へ
    名古屋市科学館 名古屋市立大学と名古屋市科学館は、次世代の科学系・技術系人材の育成と地域社会の発展を目指し、平成28年3月にサイエンスパートナーシップを締結しました。名古屋市立大学の理系教員と名古屋市科学館の学芸員が「生命科学」の魅力を伝えるとともに、研究者や学芸員との交流を通じて、名市大での最先端研究や科学館の魅力を紹介しした。
  • Date (from-to) : 2016/11/06
    Role : Planner
    Category : Lecture
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学、名古屋市科学館
    名古屋市科学館 名古屋市立大学と名古屋市科学館は、次世代の科学系・技術系人材の育成と地域社会の発展を目指し、平成28年3月にサイエンスパートナーシップを締結しました。名古屋市立大学の理系教員と名古屋市科学館の学芸員が「生命科学」の魅力を伝えるとともに、研究者や学芸員との交流を通じて、名市大での最先端研究や科学館の魅力を紹介しました。
  • Date (from-to) : 2015/11/20
    Role : Lecturer
    Category : Science cafe
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学システム自然科学研究科
    Event, Program, Title : 第104回 サイエンスカフェ イン 名古屋
  • Date (from-to) : 2013/10/18
    Role : Lecturer
    Category : Science cafe
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学システム自然科学研究科
    Event, Program, Title : 第81回 サイエンスカフェ イン 名古屋
  • Date (from-to) : 2011/10/21
    Role : Lecturer
    Category : Science cafe
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学システム自然科学研究科
    Event, Program, Title : 第59回 サイエンスカフェ イン 名古屋
  • Date (from-to) : 2010/01/15
    Role : Lecturer
    Category : Science cafe
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学システム自然科学研究科
    Event, Program, Title : 第41回 サイエンスカフェ イン 名古屋
  • Date (from-to) : 2007/05/18
    Role : Lecturer
    Category : Science cafe
    Sponser, Organizer, Publisher  : 名古屋市立大学システム自然科学研究科
    Event, Program, Title : 第11回 サイエンスカフェ イン 名古屋

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